Tras el ataque Chitauri a la Tierra repelido por Los Vengadores, el agente Coulson, recién resucitado, forma un equipo de agentes especiales, S.H.I.E.L.D., para afrontar un mundo lleno de superhéroes, seres y tecnología alienígena y hechos aparentemente “paranormales”.

Con la aparición de HYDRA, un antiguo grupo terrorista obsesionado con la conquista del planeta, los agentes de S.H.I.E.L.D. tendrán que viajar por todo el mundo investigando y combatiendo todo tipo de amenazas…

La serie empieza un poco lenta siendo cada capítulo una historia diferente, pero pronto la aparición de HYDRA y otras amenazas hacen que la narración se convierta en una clásica historieta de cómic del universo MARVEL.